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代谢全谱分析检测

2020-07-27 17:30:00  来源: 青岛科创质量

非靶代谢组学无偏向性检测所有内源小分子代谢物,通过全谱分析对小分子代谢物定性和相对定量,了解生物体内小分子代谢物的整体代谢特征和变化规律。基于代谢全谱的功能探究,便于从整体水平,在复杂的代谢网络中寻找潜在的重要通路,是解决复杂生物学问题的重要途经,也是许多科学研究进一步深入的前提。

  可靠的检测平台和分析软件为高质量检测数据保驾护航

  全谱分析技术流程

  以上为代谢物全谱分析的基本流程,下面我们开始细述各类细节。

  1、 样本保存

  离体样本必须在液氮速冻后-80℃保存,严禁反复冻融。

  2、 样品前处理

  在代谢组学研究中,最常用的样本前处理方式是有机溶剂沉淀蛋白,接着使用高速离心或者超滤技术移除沉淀。研究者们喜欢用有机溶剂例如甲醇进行一步提取,既缩短前处理时间,又可以避免过多的杂质混入,缩短色谱柱寿命,影响检测结果。在某品牌眼药水全谱分析过程中,代谢物提取步骤为加甲醇涡旋、静止、离心和过滤收集上清。

  3、 代谢物检测

  LC-MS、GC-MS或核磁共振对代谢物进行定性和定量检测,如Thermo, Ultimate 3000LC +Thermo Scientific™ Q Exactive™ HF液质联用仪,以液相色谱作为分离系统,质谱为检测系统,样品在质谱部分和流动相分离,被离子化后,经质谱的质量分析器将离子碎片按质量数分开,经检测器得到质谱图,获得原始数据。

  4、 离子流图

  (ESI+)表示正离子检测模式,即在检测过程中质量分析器只扫描正电荷离子而滤除负电荷离子,从而获得正电荷离子的信息;(ESI-)表示负离子检测模式,原理同正离子模

  5、数据预处理

  数据处理的软件众多,针对Thermo Scientific™ Q Exactive™ HF原始数据对应专门分析软件Compound discoverer 3软件,可对LC/MS检测数据进行提取和预处理,整理成二维数据矩阵形式,包含保留时间RT(Retention time)、分子量(Molecular Weight)、观察量(样本名称)、峰强度等信息,进行后续去全谱鉴定。

  6、 全谱鉴定

  根据LC-MS产生的二级质谱图或者Mass值基于mzCloud数据库和网络数据库Metlin进行全谱鉴定,对代谢物注释和分类。例如某品牌眼药水的全谱分析鉴定其主要包括亚油酸及其衍生物、脂肪酸及其衍生物、氨基酸及其衍生物和吲哚基羧酸及其衍生物等。

  全谱分析技术优势

  全谱分析应用

  代谢物全谱分析可广泛应用于农业、医疗和生产各个领域中,丰富的样本前处理经验,高通量的质谱检测和专业的数据处理分析,可高效准确地获取全谱分析结果。

  关于科创质量

  科创质量是一家专业从事生命科学相关领域研究的技术服务公司。作为专业的一站式技术解决方案供应商,科创以科学研究为首任,以客户为中心,向全国生物医药企业和高校科研院所提供一系列的技术服务,并致力于搭建全国生物医药领域研发服务平台。公司实验室配置精良,拥有庞大的谱图解析数据库和专业的分析研发工程师,可为客户提供专业可靠的分析检测服务。



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